W latach 80. XX w. z parafii św. Mikołaja została wyodrębniona nowa wspólnota. Nie zrodziła się z kurialnego dekretu, ale z pragnień mieszkańców, zwłaszcza powstałego w tamtym czasie nowego osiedla – św. Jana, które stało się domem dla bocheńskich hutników i ich rodzin. Wielu z nich przyszło do miasta z okolicznych wiosek. Z jednej strony nie czuli się związani ze św. Mikołajem, z drugiej chcieli własnej parafii, w przeciwieństwie do obecnie napływających do Bochni ludzi, którzy nie myślą w ogóle o identyfikacji z jakąkolwiek bocheńską wspólnotą.