Ks. dr Stefan Cichy został mianowany biskupem pomocniczym archidiecezji katowickiej 26 sierpnia 1998 roku. Jako stolica tytularna została mu nadana Bonusta.

Sakrę biskupią otrzymał dokładnie 12 września 1998 r. w katowickiej archikatedrze. Głównym konsekratorem był ówczesny metropolita katowicki abp Damian Zimoń. Współkonsekratorami byli zaś bp Stanisław Szymecki i bp Wiktor Skworc.

Jako zawołanie biskupie nowy biskup obrał słowa: „Per Crucem ad Lucem” ("Przez Krzyż do Światła").

19 marca 2005 roku bp Stefan Cichy został powołany przez papieża Jana Pawła II do posługi biskupa legnickiego. Swój urząd objął w dzień Ingresu, tj. 30 kwietnia 2005 roku.

W czerwcu 2009 r. został wyróżniony przez Radę Miasta tytułem Honorowego Obywatela Miasta Legnica.

12 września we wszystkich parafiach jest dniem modlitwy w intencji pasterza Kościoła legnickiego.